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目前，淘宝已经开始向商城店铺收取包括店铺服务费、二级域名服务费、保证金、信息查询费等在内的多项费用，根据店铺等级的不同，具体费用标准也有所不同。对于老用户，收费早在4月1日就已经开始，对于新入驻的商户，从入驻之日起即开始收费。
淘宝网在网络交易市场一直打着免费的旗号，也正是依靠这个，淘宝网聚集了很多人气，大批用户来到淘宝网进行交易。在聚集大量用户、打败竞争对手、树立行业第一品牌等等这些目的达到后，淘宝网就背弃了免费3年的承诺，中途开始对商户施行收费。这种出尔反尔的做法让那些已经进驻淘宝网的商户颇感无奈。
2006年淘宝网全年交易总额突破169亿元，超过易初莲花(100亿元)、沃尔玛(99.3亿元)各自在国内全年营业额。但淘宝网始终未能从中获利，在这些数字背后，扮演的不过是为他人做嫁的无奈角色。淘宝网目前亟需找到一种适合的盈利模式来改变这种现状。另一方面，在巨大的经济压力下，淘宝网希望能尽快实现盈收。据业内人士表示：支撑淘宝正常运转一年也至少需要3、4亿的成本。淘宝免费了这么多年，阿里巴巴系已经不堪重负。在众多收费理由的驱使下，淘宝网开始收费。
淘宝网的声明中表示，对品牌商城的商户收费，是对B2C业务的收费，C2C方面还是继续免费的。但是淘宝网显然并没有做好为B2C商户提供服务的准备。从网站的页面来看，仍然是传统的C2C交易页面。对比一下B2C行业的当当网页面就可以看出，淘宝网的许多服务都没有跟上，例如最基本的各种TOP排名都没有。包括对商户的产品展示也很薄弱。淘宝网对商户提供服务最差的方面就是人流量。淘宝网巨大的人流量下，品牌商城的访问却相对很少。原因就是淘宝网将品牌商城独立出来，在淘宝首页无论搜索还是产品分类，消费者都看不到商户的产品信息，必须进入品牌商城频道内才可以进行相关操作。实际上淘宝网巨大的人流量只是表象，根本就没有为商户提供服务。
从收费的原因和为商户提供服务的情况来看，淘宝网本次的收费行为，只是站在收钱的角度进行，并不想为商户提供任何支持，并没有做好转向B2C的准备。相比于当当网店中店通过为商户提供各种服务来收费，淘宝网还需要拿出些诚意来，防止商户的流失。